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Apr. 18, 2004  Vol.6 No.4 P.22 Copyright cij17logo.gif (917 bytes)


Kinetic and mechanism investigation of bis(L-histidino)zinc(II) catalyzing p-nitrophenyl acetate hydrolysis

Chen Huamei, Yue Fan, Wang Jide*, Feng Shun, Liu Aihua ,Yang Hongwei
(College of Chemistry and Chemical Engineering, Xinjiang University, Urumqi 830046)

Abstract The kinetic of bis(L-histidino)zinc(II) catalyzing p-nitrophenyl acetate(NA) hydrolysis was investigated at 20°C,pH 8.1-9.4 by kinetic spectrophotometic analysis. The catalytic rate follows the law of dC/dt = ( kobs CZn+ kOH [OH-1] + k0 ) CNA.The hydroxyl specie Zn(his)2(OH)- is the active specie as a nucleophile reagent promoting NA hydrolysizing at the range of pH. The rate constant of Zn(his)2(OH)- hydrolysizing NA is 0.287 mol-1· L ·s-1. By the analysis of the crystal structures of Zn(his)2·n H2O (n = 2 or 5) , in which the a-amino of histidine forms a hydrogen bond with a water molecular, we deduced that in the process of NA hydrolysis the hydroxyl of Zn(his)2(OH)- is bonded on the a-amino of histidine by hydrogen bond, not directly bonded on the central metal ion-Zn(II) in basic buffer solution as generally known.
Key words bis-(L-histidine)-zinc(II),hydrolytic metalloenzyme, kinetic spectrophotometric analysis.

组氨酸锌对p-硝基苯酚醋酸酯的催化水解动力学及机理研究

陈华梅 岳凡 王吉德* 封顺 刘爱华  杨红伟
(新疆大学化学化工学院, 乌鲁木齐, 830046)

2003年12月31日收稿

摘要 pH=8.1-9.4范围内,于402 nm处,用动力学光度法测定了配合物组氨酸锌催化p-硝基苯酚醋酸酯(NA)的水解速率。催化水解速率对底物(NA)和配合物浓度均呈一级反应,水解反应遵循速率方程dC/dt =(kobs CZn + kOH [OH-] + k0) CNA,催化反应受酸碱平衡控制,在此pH范围内Zn(his)2(OH)- 是催化型体,其上的亲核基团羟基以氢键结合在配体his的a-氨基上。
关键词 组氨酸锌;金属水解酶;动力学光度法。

    生物体内有很多含金属离子的水解酶,它们能水解蛋白质、磷酸酯、DNA等重要的生命物质,在生物化学反应中起着极其重要的作用。由于天然金属酶结构复杂、稳定性差,对结果的解释也较烦琐,因而模型分子为研究生命过程提供了广泛的可行性。合成具有独特结构的相应酶功能的新的金属酶模型化合物,研究酶相应模型化合物的结构、生物功能和作用机制之间的规律性,将能进一步揭开金属酶的本质[1]
    含金属的水解酶如碳酸酐酶、羧肽酶、磷酸酯酶等的活性中心结构和催化机理是生物无机化学的热点问题。酶模型研究为我们提供了酶的可能的催化机理。由于锌离子是缺信息(光学、磁学等)离子,现有的研究手段受到很大限制。到目前为止,最成功的模型配合物多为Co3+ [ 2,3]、Cu2+[4,5]的配合物,但Zn2+在水解酶中更常见。如目前研究比较成熟的羧肽酶和碳酸酐酶(CA酶)。羧肽酶的活性中心是Zn2+与多肽链的两个组氨酸(69和196)的咪唑基氮原子,以及谷氨酸(72)的羧基氧原子以配位键结合,第四个配位位置与一个水分子松弛地连接,处于畸变的四面体状态。CA酶的活性部位由Zn2+ 与三个组氨酸(93、95和117)的3个咪唑基氮原子配位,第四个配位位置可能为水分子或羟基占据,形成畸变的四面体结构[1]。因此以锌(Ⅱ)配合物作为水解酶模型物的研究更有意义。
    基于组氨酸锌在配位环境上更接近生物酶的结构的想法,本文以组氨酸锌作为水解酶的模拟物,以p-硝基苯酚醋酸酯(NA)为底物,研究了其对NA的水解动力学及其机理。用动力学光度法测定了组氨酸锌水解NA的速率,得到了其速率常数;讨论了水解过程的机理,亲核试剂Zn(his)2(OH)-为活性物种,提出水解过程中羟基不是直接结合在金属离子上的,而是结合在配体his的氨基上的。
                  

羧肽酶A分子中Zn2+配位环境
The circumstance of zinc(II) in the
mocular of carboxylesterase A

1 实验部分
1.1 仪器与试剂

    MP230型pH计(精度0.001, 配有Inlab 413型电极,Mettler-Toledo上海有限公司);40270300l型移液器(100-1000
ml ,1-5 ml ,芬兰Labsystems公司),UV-2450紫外-可见分光光度计(日本Shimadzu公司)。
    L-组氨酸(his,光谱纯, 新兴医保), p-硝基苯酚醋酸酯(NA,Sigma,USA),三羟基甲基氨基甲烷(Tris, 北京奥博星公司), ZnCl2 (分析纯),其余试剂均为分析纯。
1.2 实验方法

    NA水解反应动力学研究在紫外-可见分光光度计上进行,跟踪水解产物p-硝基苯酚阴离子(NP)在402 nm波长下的吸光度,水解反应速
率用初始斜率法求得。温度为20℃,以KNO3 控制离子强度I = 0.1 mol·L-1,缓冲溶液0.02 mol·L-1 Tris–HCl。准确称取ZnCl2 : his = 1 : 2 , 用pH = 8.5的缓冲溶液配制得配合物溶液。将一定体积的配合物溶液、支持电解质和缓冲溶液的混合液加入到比色皿中,最后用移液器加入一定量的NA的乙腈溶液盖上盖子并迅速摇匀,放入仪器进行测试。反应混和液中含10%(v/v)的乙腈,对溶液pH影响很小。用动力学光度法, 测定水解产物NP在402 nm的吸光度随时间变化率dA/dt,由此得到反应速率u= dC/dt = 1/eobs ·dA/dt(eobs为NP的表观摩尔吸光系数),取反应后1分钟内的点,其转化率小于5%,测试至少重复三次。
1.2.1 NP表观摩尔吸光系数
eobs的测定
    为测定配合物催化NA水解的速率,首先测定水解产物NP ( CNP = 5.000×10-5 mol
·L-1)在实验条件下的吸光度,波长为402 nm,得到eobs,结果见表1。Zn(his)2在在此波长无吸收。

1 NP于402nm处的表观摩尔吸光系数eobs
Table 1 The apparent molar coefficient of absorbtion eobs of NP at 402nm
( I = 0.1 mol·L-1 KNO3 , 0.02 mol·L-1 Tris HCl , 10%v/vCH3CN )

pH

8.108

8.314

8.532

8.722

9.132

9.394

eobs

16880

17620

17920

18360

18640

18640

1.2.2催化反应速率随CNA的变化
    恒定
CZn = 2 m mol·L-1,(CZn为溶液中锌的总浓度),pH = 8.532, 测定催化反应速率u随CNA的变化。反应速率u= dC/d t = 1/eobs· dA/dt,由实验得到的dA/dt及eobs ,可得dC/dt与CNA的关系,反应对NA呈一级反应,相关系数r = 0.999,结果见图1。
1.2.3催化反应速率随CZn的变化
    恒定CNA = 5 m mol
·L-1,在不同pH下,测定催化反应速率随CZn的变化,得到dA/dt与CZn的关系,结果见图2,反应对CZn呈一级反应,相关系数r = 0.942-0.996。

1 CZn = 2 m mol
·L-1, pH = 8.532, dA/dt(×103s-1 ) CNA的变化
Fig.1 CZn = 2 m mol·L-1, pH = 8.532, dA/dt(×103 s-1) vs. CNA (m mol·L-1)

2 dA/dt (×103 s-1) CZn (m mol
·L-1)的变化
Fig.2 dA/dt (×103 s-1) vs. CZn (m mol·L-1)

2 结果与讨论
2.1 kobs
与配合物各种型体随pH的分布曲线

    配体质子化常数及配合物稳定常数见表2,并用Repro40和Repro程序[6]得到配合物各种型体随pH的分布曲线如图3。以下L表示配体组氨酸。

图3 配合物各种型体及kobs×103)随pH的分布曲线
Fig.3 The curves of species distribution diagram for Zn(II)-L(1:2) and kobs×103vs. pH

2 配体质子化常数及配合物稳定常数
Table 2 The protanation constants of ligand and stability constants of Zn-L complexes ( 25.0 ± 0.1
, 0.1 mol· L-1 KNO3 )

spices

logb[6]

(his) H

9.11

(his) H2 +

15.14

(his) H32+

16.93

Zn(his)+

6.48

Zn(his)2

11.92

Zn(his)2(OH)-

1.97

Zn(his)2(OH) 22-

-8.84

    Zn(his) +在pH 5-8生成,但在溶液中最多不超过30%, Zn(his)2 在溶液中pH 7–9.5范围内占50%-90%,为主要成分,说明Zn(his)2更容易生成。Zn(his)2(OH)- 为配合物Zn(his)2中键合一个羟基,Zn(his)2(OH) 22-为配合物Zn(his)2中键合两个羟基。关于羟基与配合物的键合形式,我们参考了Kretsinger报道的Zn(his)2·2H2O[ 7 ] 和Marjorie报道的Zn(his)2·5H2O [8] 的晶体结构(如图4所示)。在Zn(his)2·2H2O和Zn(his)2·5H2O 的晶体结构中都可见到,L - his通过a-氨基和咪唑基氮原子与锌配位,羧基为弱配位,水未参与配位,而是与配体形成氢键,锌原子处于四面体中心。a- 氨基的两个氢原子,一个与his的羟基氧原子形成N━H┅O分子内氢键,使羟基氧原子靠近中心金属离子形成弱配位键,另一个与水形成N━H┅O(H2O) 分子间氢键, 同时水分子的氢原子与两分子的his的羟基氧原子形成氢键O(H2O)━H┅O(his)。所以我们可推知在碱性溶液中配体his的a- 氨基上氢键键合的水失去质子,形成氢键键合羟基。

4 组氨酸锌的晶体结构示意图
Fig.4 The crystal structure of bis(L-histidino)zinc(II)

2.2 配合物催化NA水解kobs的计算
    由图2和图3数据分析,催化反应速率dC/dt与CNA和CZn均呈线性关系,总反应为二级反应。配合物不存在时,NA的水解仍能较快进行,是OH-所起的作用。拟定催化反应速率方程如下:
dC/dt = ( kobs
·CZn + kOH·[OH-] + k0)·CNA (1)
    kobs为配合物的表观催化水解速率常数,kOH为缓冲溶液的催化水解速率常数, ko为NA自水解速率常数,ko(10 -6 mol-1
·L·s-1 )很小可以忽略,OH- 的影响即为配合物不存在时NA的水解速率dA0/dt,即
    dA0/dt = kOH
· [OH-] · CNA·eobs (2)
    由上式可得kOH ,其平均值为3.588mol-1
·L·s-1,将kOH代入(1)式可得kobs,计算结果见图3。图中★点为kobs ,带■的曲线为Zn(his)2(OH)- 的分布曲线。
    由图中可以看出,表观速率常数kobs与物种Zn(his)2(OH)- 变化趋势相同,可知催化物种为Zn(his)2(OH)- ,可得:
kobs
· CZn = k1·[Zn(his)2(OH)]
kobs = k1
· = k·d1
    其中
d
1为Zn(his)2(OH)- 的分布系数,k1为催化NA水解的速率常数。对曲线进行拟合计算可得k1为0.287 mol-1·L·s-1

2.3催化机理
   
对金属水解酶的催化机理有三种观点[9]:(1)Lewis acid机理,金属离子作为路易斯酸和羰基氧原子作用或配位,一定程度上减弱了C = O键的强度(活化了底物),有利于亲核试剂对羰基碳原子的进攻。(2)金属离子活化水分子生成亲核能力较强的M……OH- 形式的亲核试剂。(3)前两种机理的结合,金属离子具有双重活化功能。
    本文中Zn(his)2(OH)-为活性物种,从前面对其结构的分析可知,它并不像机理(2)中所提到的配合物那样,羟基直接键合在金属离子上,而是以氢键的形式键合在
a- 氨基上的,故此我们认为它的催化机理应如图5所示。在水解反应中Zn(his)2(OH)- 为亲核试剂,其中的锌与酯的羰基氧结合,稳定并活化底物酯,同时亲核基团羟基结合并进攻羰基的正碳,形成七配位中间体;酯键断开,生成NP和醋酸根离子,配合物迅速结合一个羟基,回到原来状态。文献[ 10 ]中讲到的咪唑水解NA时的亲核试剂是咪唑上键合的水的去质子化形成的羟基形式,这与本文中羟基以氢键的形式键合在a- 氨基上是同类水解方式。

5 催化反应机理图
Fig.5 The schema of hydrolytic mechanism


REFFERENCES
[1] Ji L N
Huang J WMo T H et al. Introduction to Biological Inorganic Chemistry. (2nd)Shengwu wujihuaxue daolun. Guang Zhou: Zhong Shan University press, 2001, 42.
[2] Chin J.Banaszcayk M..J.Am.Chem.Soc., 1989, 111: 2724-2726.
[3] Jones D R,Lindoy L F,Sargeson A M. J. Am.chem.Soc., 1983, 105: 7327-7336.
[4] Yong M J,Wahnon D,Hynes R C. Chin J. J. Am.chem.Soc., 1995, 117: 9441-9447 .
[5] Morrow J R,Trogler W C.Inorg.Chem., 1988, 27: 3387-3394.
[6] W Jide,Collange E,Aymes D,et al.. Bull.Soc.Chim.Fr. , 1994, 131: 30-36
[7] Kretsinger R H,Cotton F A.Acta Cryst. 1963, 16, 651-657.
[8] Marjorie M H,Sabina J C. Acta Cryst. 1963, 16, 643-650.
[9] Ko F P, Lin H K,Zhu S R,et al. Acta Physico-Chimica Sinica (Wuli huaxue xuebao).1996, 12 (9) : 804-808
[10] Gu L Q
Ma L. Bioorganic Chemistry(Shengwu youji huaxue) Beijing: CHEP press & Springer press1998, 129-130.

 

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